No, la solicitud, la gestión y los gastos asociados no tienen coste.
Lo único que tendrás que pagar, porque no están subvencionados, son los impuestos como el IVA.
Para ello el Agente Digitalizador te hará una factura completa del servicio en la que solo tendrás que pagar el IVA (que posteriormente podrá ser compensado con otros gastos).
De esta forma si una solución de facturación te cuesta 1.000 euros + IVA únicamente tendrías que pagar al Agente Digitalizador el IVA de esa operación, 210 euros.